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浙江一体化迈杰转化医学NGS平台来电咨询 值得信赖 迈杰转化医学供应

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  • 价格面议
  • 订货量1-100件
  • 产品型号
  • 原产地江苏省
  • 品牌
  • 产品数量1000
  • 行业医药健康>医疗器具>其他医疗器具
  • 产品系列浙江一体化迈杰转化医学NGS平台来电咨询,迈杰转化医学NGS平台

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产品描述

    降低引物的扩增效率,也需要重新设计并合成引物。3、初次复合扩增时,各个引物在反应体系中的浓度均为μm;之后对引物浓度进行调整,获得进行pcr扩增时各个引物的**佳浓度。经过上述步骤,获得引物组合。引物组合由120条引物组成,用于检测68个基因座。各个基因座的名称、扩增基因座对应的引物名称和引物的核苷酸序列依次见表1中第1列、第2列和第3列。进行pcr扩增时各个引物的**佳浓度见表1中第5列。表1各个基因座对应的引物在hg38人类参考基因组(hg38人类基因组的信息见网址./goldenpath/hg38/bigzips/)中的pcr扩增产物的长度和核苷酸序列详见表2。各个str基因座的pcr扩增产物的长度范围分布见图1,浙江一体化迈杰转化医学NGS平台来电咨询。表2三、基于二代测序技术检测68个基因座的试剂盒的制备基于二代测序技术检测68个基因座的试剂盒包括引物混合物;引物混合物由步骤二制备的120条引物混合而成。实施例2、实施例1制备的试剂盒检测标准品2800m的str分型及其应用一、实施例1制备的试剂盒检测标准品2800m的str分型1、dna样本准备取标准品2800m,用超纯水稀释,获得浓度为1ng/μl的标准品2800m水溶液。2、pcr扩增以标准品2800m水溶液为模板,浙江一体化迈杰转化医学NGS平台来电咨询,采用实施例1步骤三制备的引物混合物进行pcr扩增,浙江一体化迈杰转化医学NGS平台来电咨询,得到pcr扩增产物。 迈杰拥有StarLIMS实验室信息化管理系统,中心实验室获得了中国CNAS ISO 17025实验室认可、美国CAP认证。浙江一体化迈杰转化医学NGS平台来电咨询

    图7IHC检测FGF-19过表达(左:正常胆囊组织(阳性对照);右:肝细胞*组织(弱阳性))➤➤方案4:RNAscope法评估FGFR1/2/3/4的mRNA表达水平此外,RNAscope在细胞原位评估mRNAs水平方面,能够更直接精细地确定基因的扩增状况。迈杰转化医学在数字病理平台上已经建立了检测FGFR过表达的RNAscope的方法,可以原位检测FGFR1-4mRNAs表达水平,为FGFR抑制剂的生物标志物检测和研究提供了更多可能(图8)。图8RNAscope检测肺*总FGFR1/2/3/4的mRNA表达水平除以上示范,迈杰转化医学还可提供其他类型(如PD/PK生物标志物)解决方案并已有相关经验(表7)。References:[1]HelstenT,ElkinS,ArthurE,[J].ClinicalCancerResearchAnOfficialJournaloftheAmericanAssociationforCancerResearch,2016,22(1):259.[2]TurnerN,.[J].NatureReviewsCancer,2010,10(2):116-129.[3]PetersKG,MarieJ,WilsonE,[J].Nature,1992,358(6388):678-681.[4]KangS,ElfS,DongS,.[J].MolecularandCellularBiology,2009,29(8):2105-2117.[5]BabinaIS,[J].NatureReviewsCancer,2017,17(5):318.[6]NataliaPorębska,Marta,.[J].JournalofClinicalMedicine。 浙江一体化迈杰转化医学NGS平台来电咨询迈杰转化医学针对药物研发过程中靶点、适应症及PD研究中生物标志物等研究的进行方案开发设计。

    目前市场上**成功的商业化多重PCR建库技术是ThermoFisher公司的Ampliseq技术,该技术可以在同一孔反应中完成上千对引物的扩增,使得多个靶标区域的富集可以通过一次PCR反应完成,随后加上IonTorrent测序平台的通用接头建好文库用于二代测序。然而,这个产品存在**大的缺陷是客户定制化的panel设计生产周期较长,需要两到三个月,严重的增加了时间成本;并且每个样本的建库费用高达1000-2000元,致使其经济成本极高;另外该试剂盒只适用于IonTorrent测序平台,受平台因素影响大,亦不利于测序费用的降低。技术实现要素:鉴于以上问题,本发明提供了一种基于多重PCR的二代测序建库技术,该技术可以有效的解决Ampliseq试剂盒存在的问题,对于客户定制化的panel设计生产周期只需要两周,并且可以极大的降低单个样本建库的成本,且在IonTorrent和Illumina测序平台都通用。为了实现上述发明目的,本发明提供以下技术方案:本发明中用到了两轮多重PCR来建库。首先针对每个靶标区域或者靶标位点,需要设计两条特异性引物,一条引物在另一条引物的3’下游100-150bp的位置,处于下游的引物在5’端加上二代测序平台通用的测序接头。上游的引物OP用于***轮多重PCR。

    RUROLimfinityNGS是适用于二代测序全流程的信息管理平台,包含您提到的样本前处理、样本接收、处理、样本存储、文库制备、测序、完成以及质控等全流程信息管理,实现了真正意义上样本全生命周期的管理,并且符合21CFRPart11电子签名的规定1.不要删除或篡改试验数据2.不隐藏不良的检验结果3.了解并符合审查审计追踪。每个反应还包含四种双脱氧核糖核苷酸的混合物,每一种对应一个DNA碱基。这些双脱氧核糖核苷酸与DNA单体十分类似,因此可以参与DNA链的增长,但是他们和天然的脱氧核糖核苷酸有两点不同:(1)他们缺少一个会影响DNA链进一步衍生的3’羟基。在DNA延伸过程中,这个3’羟基一旦加入DNA分子中就会导致链的终止;(2)每个双脱氧核糖核苷酸都有独特的荧光染料吸附,使得DNA测序的自动检测得以进行。 迈杰转化医学希望能和创新型药企共同探索创新生物标志物的临床应用潜力。

    ⑦侧翼序列碱基数,各部分之间用tab键隔开。按照这种格式依次对68个基因座进行录入。68个基因座基因配置文件录入完成后,运行***。该文件给出了①基因座名称,②基因分型,③扩增子碱基数,④扩增子序列信息,⑤测序深度五个部分。根据国际法医遗传学会(internationalsocietyforforensicgenetics,isfg)发表的关于y-str基因座的str序列指南()和niststr数据库(strbase.)y染色体str情况说明对67个y-str基因座的序列构建**重复结构。实验结果见表3。结果表明,标准品2800m得到了完整的str分型,完全能够满足法医str检验的要求。表3-1注:n与其后数字表示一段碱基序列,其后数字表示序列的碱基数目。表3-2注:n与其后数字表示一段碱基序列,其后数字表示序列的碱基数目。二、采用实施例1制备的试剂盒的应用——口腔拭子样本的基因座分型样本一、样本二和样本三为3名汉族男性无关个体的口腔拭子的基因组dna,浓度均为1ng/μl。3名汉族男性均知情同意。将步骤一中的标准品2800m水溶液替换为样本一、样本二或样本三,其它步骤均不变。检测结果见表3。结果表明,样本一、样本二和样本三均获得了完整的str分型结果。 迈杰转化医学利用数字PCR进行低丰度突变研究等;提供循环肿l瘤DNA检测,可检测EGFR、ERBB2等Biomarker。重庆多靶点迈杰转化医学NGS平台值得推荐

迈杰转化医学利用新一代智能技术补充传统医学的检测模式,赋能医疗健康建设,更好地为临床和患者服务。浙江一体化迈杰转化医学NGS平台来电咨询

    降低引物的扩增效率,也需要重新设计并合成引物。3、初次复合扩增时,各个引物在反应体系中的浓度均为μm;之后对引物浓度进行调整,获得进行pcr扩增时各个引物的**佳浓度。经过上述步骤,获得引物组合。引物组合由120条引物组成,用于检测68个基因座。各个基因座的名称、扩增基因座对应的引物名称和引物的核苷酸序列依次见表1中第1列、第2列和第3列。进行pcr扩增时各个引物的**佳浓度见表1中第5列。表1各个基因座对应的引物在hg38人类参考基因组(hg38人类基因组的信息见网址./goldenpath/hg38/bigzips/)中的pcr扩增产物的长度和核苷酸序列详见表2。各个str基因座的pcr扩增产物的长度范围分布见图1。表2三、基于二代测序技术检测68个基因座的试剂盒的制备基于二代测序技术检测68个基因座的试剂盒包括引物混合物;引物混合物由步骤二制备的120条引物混合而成。实施例2、实施例1制备的试剂盒检测标准品2800m的str分型及其应用一、实施例1制备的试剂盒检测标准品2800m的str分型1、dna样本准备取标准品2800m,用超纯水稀释,获得浓度为1ng/μl的标准品2800m水溶液。2、pcr扩增以标准品2800m水溶液为模板,采用实施例1步骤三制备的引物混合物进行pcr扩增,得到pcr扩增产物。浙江一体化迈杰转化医学NGS平台来电咨询

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