浦斯瑞(上海)生物医药有限公司
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1stStrandcDNASynthesisKit(RNaseH-)是一种用于合成互补DNA(cDNA)的试剂盒,它通过逆转录过程从信使RNA(mRNA)或总RNA模板合成cDNA的链。这类试剂盒通常包含逆转录酶(ReverseTranscriptase,RT)和其他必要的组分,以确保高效和准确的cDNA合成。RNaseH-表示该试剂盒使用的逆转录酶缺乏RNaseH活性,这意味着在合成cDNA链的过程中不会发生RNA的降解,从而可以产生更高产量的全长cDNA,特别是从较长的模板(可达13kb)。该试剂盒通常包括以下组分:-逆转录酶,如RevertAidHMinusM-MuLVReverseTranscriptase,它通过点突变完全消除了RNaseH活性。-RiboLockRNaseInhibitor,这是一种重组蛋白,可有效保护RNA在高达55°C的温度下不受RNases的降解。-缓冲液、dNTPs(去氧核苷酸三磷酸)和其他辅助成分,以支持cDNA合成反应。-有时还包括用于去除RNA样品中污染的基因组DNA的DNaseI。合成的cDNA可以作为PCR或实时PCR的模板直接使用,也适用于第二链cDNA合成或线性RNA放大。此外,可以在cDNA合成过程中加入放射性或非放射性标记的核苷酸,以便在包括微阵列在内的杂交实验中作为探针使用。将合成的gRNA与Cas9 NLS蛋白混合,形成复合物。由于Cas9 NLS蛋白两端都有NLS,有助于复合物快速进入细胞核。MARK Substrate
DNaseI是一种使用的酶,它能够水解单链或双链DNA,产生5'端为磷酸基团的二核苷酸、三核苷酸或更短的寡核苷酸片段。这种酶的活性依赖于钙离子,并且可以被镁离子或二价锰离子启动。在镁离子存在的情况下,DNaseI可以随机剪切双链DNA的任意位点;而在二价锰离子存在时,它可以在同一位点剪切DNA双链,形成平末端或1-2个核苷酸突出的粘末端。DNaseI的一个特点是它不含RNase活性,因此可以用于处理各种RNA样品,而不会对RNA造成降解。DNaseI的应用非常广,包括但不限于:-制备不含DNA的RNA样品;-在RT-PCR反应前去除RNA样品中可能的DNA污染;-体外RNA聚合酶催化的RNA转录后去除DNA模板;-进行DNaseI足迹实验研究DNA-蛋白质相互作用;-缺口平移(nicktranslation);-产生DNA随机片段文库;-在细胞凋亡TUNEL检测中部分剪切基因组DNA作为阳性对照。DNaseI通常从牛胰腺中纯化得到,其分子量约为32kDa(单体)。活性定义为在37℃、10分钟内,能够完全降解1μgpBR322质粒DNA所需的酶量。在实验中,DNaseI的活性单位通常以Kunitz单位来表示,该单位是基于特定条件下酶降解DNA的能力来定义的。Recombinant Cynomolgus CCR8 Protein,mFc Tag牛痘DNA拓扑异构酶I具有特异性识别能力,能够识别双链DNA中的5'-(C/T)CCTT-3'序列。
Lambda核酸外切酶的活性表现在其高度特异性和过程性地消化5'端磷酸化的双链DNA。以下是一些关键点,描述了Lambda核酸外切酶的活性特征:1.**高度过程性(HighlyProcessive)**:Lambda核酸外切酶是一种高度过程性的5'→3'外切酶,这意味着它能够连续消化多个核苷酸,而不需要在每一步之后重新结合底物。2.**底物特异性(SubstrateSpecificity)**:该酶选择性地消化5'端磷酸化的双链DNA链,对单链DNA和非磷酸化DNA表现出低活性。3.**活性定义(ActivityDefinition)**:一个活性单位定义为在37°C下,30分钟内在50μl反应体积中,使用1XLambdaExonucleaseReactionBuffer和1μg声波破碎的双链[3H]-DNA底物,产生10nmol酸溶性脱氧核苷酸所需的酶量。4.**反应条件(ReactionConditions)**:通常在37°C下进行孵育,使用1XLambdaExonucleaseReactionBuffer,该缓冲液包含67mMGlycine-KOH,2.5mMMgCl2,50µg/mlBSA,pH值为9.4。5.**热失活(HeatInactivation)**:通过在75°C下加热10分钟可以使Lambda核酸外切酶失活。6.**特定活性(SpecificActivity)**:Lambda核酸外切酶的特定活性为50,000单位/毫克蛋白。
pA-Tn5转座酶是一种经过特殊改造的融合蛋白,由ProteinA和高活性的Tn5转座酶组成,具有以下主要应用:1.**高通量测序建库**:pA-Tn5转座酶可以用于快速构建用于高通量测序的DNA文库,通过其转座酶活性实现DNA片段化,同时加上测序接头,简化了传统DNA测序建库的多步过程。2.**CUT&Tag技术**:这是一种新兴的蛋白质与DNA相互作用研究方法,pA-Tn5转座酶利用ProteinA与特定抗体结合,将转座酶带到目标蛋白附近进行DNA切割和标签添加,实现对蛋白质结合位点的高通量测序分析。CUT&Tag技术具有高特异性、低背景噪音、高灵敏度、良好重复性等优点,适用于表观遗传学、干细胞等领域的研究。3.**ATAC-seq**:pA-Tn5转座酶也可用于ATAC-seq实验,这是一种研究染色质可及性的方法,通过转座酶在没有核酸酶消化的情况下切割染色质DNA,然后在切割位点加上测序接头,进行后续的测序分析。4.**转录组测序快速建库**:有研究开发了基于Tn5转座酶的转录组测序快速建库方法,例如SHERRY方法,它利用Tn5转座酶直接作用于RNA/DNA杂交链,简化了建库过程,适用于单细胞转录组测序,提高了样本的利用率和测序速度。
核酸(DNA和RNA)的可视化是分子生物学实验中的一项基本技术,用于检测和分析核酸的存在、大小、数量和纯度。以下是几种常用的核酸可视化方法:1.**紫外线(UV)检测**:-利用核酸分子对UV光的吸收特性,特别是在260nm波长下的吸收峰。-常用的UV检测方法包括凝胶电泳后的凝胶成像系统,可以观察到凝胶中DNA或RNA的条带。2.**荧光染料染色**:-使用荧光染料,如溴化乙锭(EthidiumBromide,EB)或SYBRGreen,这些染料可以与核酸结合并在特定波长的光照射下发出荧光。-EB常用于凝胶电泳后的DNA可视化,而SYBRGreen可用于实时定量PCR(qPCR)中DNA的检测。3.**凝胶电泳**:-通过将核酸样品加载到凝胶中,利用电场驱动核酸分子按大小分离,然后通过上述的UV或荧光染料进行可视化。4.**紫外交联**:-某些荧光染料,如BODIPY或Cy5,可以通过紫外交联直接结合到核酸上,提供更高的灵敏度和特异性。5.**银染**:-一种比EB染色更灵敏的染色方法,通过银离子与核酸的结合,然后还原成金属银,形成可见的黑色或棕色条带。6.**化学发光检测**:-使用特定的化学发光底物,如荧光素或鲁米诺,与核酸结合后,在氧化过程中产生光信号。Cas9 NLS可用于体外实验中筛选能够高效引导Cas9蛋白进行DNA剪切的gRNA序列 。Recombinant Mouse EREG Protein,hFc Tag
在一项研究中,比较了具有不同NLS融合的Cas9蛋白和Cas9 mRNA在斑马鱼基因组编辑中的效率。MARK Substrate
Benzonase核酸酶残留检测试剂盒通过以下方式实现高灵敏性:1.**荧光探针技术**:试剂盒采用荧光标记的DNA探针,这种探针在没有Benzonase核酸酶的样品中稳定存在且不产生荧光信号。当样品中含有核酸酶残留时,核酸酶会切割荧光标记的DNA探针,导致荧光信号的增强。这种变化可以用来定量分析Benzonase的残留量,实现高灵敏度检测。2.**荧光共振能量转移(FRET)**:该技术利用了供体(Donor)和受体(Acceptor)荧光基团间的相互作用。在未切割状态下,供体的荧光被受体淬灭,而一旦DNA探针被Benzonase切割,供体荧光基团与受体分离,荧光信号增强,从而实现高灵敏度的检测。3.**优化的底物探针**:试剂盒中的Benzonase底物是一种合成的DNA寡核苷酸探针,其一端具有VIC荧光基团,另一端具有BHQ1淬灭基团。这种设计使得在底物被切割后,VIC荧光不再被BHQ1淬灭,从而可以非常灵敏地检测到Benzonase核酸酶活性。4.**高灵敏度的检测范围**:试剂盒能够检测到低达约0.002U(约0.003ng)的Benzonase或BeyoZonase,样品中的Benzonase浓度约为0.0002U/μl或0.3pg/μl,这远低于常规同类产品的检测限。MARK Substrate